近亲繁殖是指血缘关系相近的公母猪之前的交配，如父女猪间，母子猪间，兄妹猪间，姐弟猪间，祖父孙女之间，祖母孙子之间，祖父侄女之间，同父异母，同母异父之间的交配等，其害处较大，在生产上一般不使用，主要表现在以下几方面。
（1）降低繁殖力：近亲交配繁殖使母猪产仔数减少，仔猪成活率降低，
（2）抑制后代发育。近亲交配繁殖的后代体型较小，体质变弱，生长缓慢，对外界不良环境的抵抗力降低。，
（3）降低后代利用饲料的能力。
（4）后代易出现畸形怪胎或死胎。如有的仔猪无肛门，耳朵，眼睛，四肢发育不全，头大，水肿等等。
